MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 2419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	GA	3	6	32	37	50 %	0 %	50 %	0 %	125654606
2	NC_009007	TTC	2	6	188	193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654606
3	NC_009007	CCG	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
4	NC_009007	CGC	2	6	281	286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
5	NC_009007	CCG	3	9	291	299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
6	NC_009007	C	8	8	315	322	0 %	0 %	0 %	100 %	125654606
7	NC_009007	CCCGGC	2	12	355	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
8	NC_009007	GCG	2	6	367	372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
9	NC_009007	GCG	2	6	395	400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
10	NC_009007	CGC	2	6	408	413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
11	NC_009007	CG	3	6	437	442	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
12	NC_009007	CG	3	6	462	467	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
13	NC_009007	CG	3	6	477	482	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
14	NC_009007	CGGGC	2	10	518	527	0 %	0 %	60 %	40 %	125654606
15	NC_009007	GCG	2	6	530	535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
16	NC_009007	GC	3	6	571	576	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
17	NC_009007	CCGG	2	8	595	602	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
18	NC_009007	GGCG	2	8	606	613	0 %	0 %	75 %	25 %	125654606
19	NC_009007	CGG	4	12	627	638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
20	NC_009007	AGGC	2	8	641	648	25 %	0 %	50 %	25 %	125654606
21	NC_009007	CTC	2	6	687	692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654606
22	NC_009007	GCCG	2	8	702	709	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
23	NC_009007	C	6	6	713	718	0 %	0 %	0 %	100 %	125654606
24	NC_009007	CGCGG	2	10	723	732	0 %	0 %	60 %	40 %	125654606
25	NC_009007	CCA	2	6	738	743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654606
26	NC_009007	GAG	2	6	862	867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654606
27	NC_009007	TCT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654606
28	NC_009007	GGGC	2	8	891	898	0 %	0 %	75 %	25 %	125654606
29	NC_009007	AGC	2	6	901	906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
30	NC_009007	CGG	3	9	918	926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
31	NC_009007	GC	3	6	1008	1013	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
32	NC_009007	CGG	2	6	1062	1067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
33	NC_009007	TGG	2	6	1079	1084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654606
34	NC_009007	CAC	2	6	1122	1127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654606
35	NC_009007	CGA	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
36	NC_009007	GAT	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654606
37	NC_009007	GC	3	6	1261	1266	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
38	NC_009007	GAG	2	6	1267	1272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654606
39	NC_009007	TCG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654606
40	NC_009007	CCT	2	6	1380	1385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654606
41	NC_009007	CAG	3	9	1396	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
42	NC_009007	CTG	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654606
43	NC_009007	ACC	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654606
44	NC_009007	GAAC	2	8	1476	1483	50 %	0 %	25 %	25 %	125654606
45	NC_009007	GAG	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654606
46	NC_009007	GCG	2	6	1541	1546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
47	NC_009007	GCACCG	2	12	1547	1558	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	125654606
48	NC_009007	CCA	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654606
49	NC_009007	CGC	2	6	1638	1643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
50	NC_009007	ACG	2	6	1655	1660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
51	NC_009007	CAG	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
52	NC_009007	TGA	2	6	1763	1768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654606
53	NC_009007	CGG	2	6	1770	1775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
54	NC_009007	GGT	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654607
55	NC_009007	GC	3	6	1916	1921	0 %	0 %	50 %	50 %	125654607
56	NC_009007	GGGC	2	8	1977	1984	0 %	0 %	75 %	25 %	125654607
57	NC_009007	TGC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654607
58	NC_009007	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654607
59	NC_009007	CGA	2	6	2293	2298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654607
60	NC_009007	CGG	2	6	2304	2309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654607
61	NC_009007	GC	4	8	2350	2357	0 %	0 %	50 %	50 %	125654607
62	NC_009007	GGA	2	6	2362	2367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654607
63	NC_009007	GAGCG	2	10	2368	2377	20 %	0 %	60 %	20 %	125654607
64	NC_009007	GAA	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654607
65	NC_009007	ACG	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654607
66	NC_009007	CCA	2	6	2485	2490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654607
67	NC_009007	ATG	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654607
68	NC_009007	CGA	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654607
69	NC_009007	GGGCGA	2	12	2545	2556	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	125654607
70	NC_009007	GCC	3	9	2567	2575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654607
71	NC_009007	GCG	2	6	2606	2611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654607
72	NC_009007	GCGG	2	8	2622	2629	0 %	0 %	75 %	25 %	125654607
73	NC_009007	GGCCC	2	10	2637	2646	0 %	0 %	40 %	60 %	125654607
74	NC_009007	CGAG	2	8	2658	2665	25 %	0 %	50 %	25 %	125654607
75	NC_009007	TCGC	2	8	2983	2990	0 %	25 %	25 %	50 %	125654608
76	NC_009007	CG	4	8	3007	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
77	NC_009007	TCG	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654608
78	NC_009007	CCG	2	6	3029	3034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
79	NC_009007	GCC	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
80	NC_009007	CGG	2	6	3108	3113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654608
81	NC_009007	GGAGCG	2	12	3148	3159	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	125654608
82	NC_009007	CGGA	2	8	3191	3198	25 %	0 %	50 %	25 %	125654608
83	NC_009007	GCC	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
84	NC_009007	CCG	2	6	3227	3232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
85	NC_009007	CTCGGC	2	12	3264	3275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	125654608
86	NC_009007	CGGCG	2	10	3282	3291	0 %	0 %	60 %	40 %	125654608
87	NC_009007	GCC	2	6	3301	3306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
88	NC_009007	TCC	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
89	NC_009007	GCC	2	6	3341	3346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
90	NC_009007	CCAGCC	2	12	3356	3367	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	125654608
91	NC_009007	AGCGC	2	10	3389	3398	20 %	0 %	40 %	40 %	125654608
92	NC_009007	GC	3	6	3407	3412	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
93	NC_009007	GCT	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654608
94	NC_009007	GC	5	10	3534	3543	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
95	NC_009007	GGCC	2	8	3557	3564	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
96	NC_009007	GGCCGC	2	12	3597	3608	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
97	NC_009007	CCGG	2	8	3614	3621	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
98	NC_009007	CTC	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
99	NC_009007	CGC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
100	NC_009007	TCA	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654608
101	NC_009007	CTC	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
102	NC_009007	AGCC	2	8	3832	3839	25 %	0 %	25 %	50 %	125654608
103	NC_009007	CTC	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
104	NC_009007	TCGAGC	2	12	3853	3864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	125654608
105	NC_009007	GCA	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654608
106	NC_009007	GCC	2	6	3875	3880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
107	NC_009007	GCGG	2	8	3888	3895	0 %	0 %	75 %	25 %	125654608
108	NC_009007	CTC	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
109	NC_009007	GCC	2	6	3925	3930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
110	NC_009007	GCC	3	9	3934	3942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
111	NC_009007	GGCCG	2	10	4032	4041	0 %	0 %	60 %	40 %	125654608
112	NC_009007	GCC	2	6	4050	4055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
113	NC_009007	G	7	7	4058	4064	0 %	0 %	100 %	0 %	125654608
114	NC_009007	CGCTTG	2	12	4075	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654608
115	NC_009007	GCC	3	9	4232	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654609
116	NC_009007	CTC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654609
117	NC_009007	GCC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654609
118	NC_009007	CCA	2	6	4263	4268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654609
119	NC_009007	GGC	2	6	4282	4287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654609
120	NC_009007	GCC	2	6	4454	4459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654609
121	NC_009007	CTG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654609
122	NC_009007	CGT	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654609
123	NC_009007	GC	3	6	4499	4504	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
124	NC_009007	CTC	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654609
125	NC_009007	GC	3	6	4542	4547	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
126	NC_009007	GCG	2	6	4550	4555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654609
127	NC_009007	CTC	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654609
128	NC_009007	GCA	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654609
129	NC_009007	GAA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654609
130	NC_009007	TCGAA	2	10	4617	4626	40 %	20 %	20 %	20 %	125654609
131	NC_009007	AGGA	2	8	4631	4638	50 %	0 %	50 %	0 %	125654609
132	NC_009007	CAG	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654609
133	NC_009007	GCC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654609
134	NC_009007	CGG	2	6	4705	4710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654609
135	NC_009007	CGT	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654609
136	NC_009007	GC	3	6	4851	4856	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
137	NC_009007	CG	3	6	4903	4908	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
138	NC_009007	TCT	2	6	4911	4916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654609
139	NC_009007	CGG	2	6	4948	4953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654609
140	NC_009007	CGC	2	6	4956	4961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654609
141	NC_009007	GGCG	2	8	5007	5014	0 %	0 %	75 %	25 %	125654609
142	NC_009007	TCG	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654609
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172	NC_009007	GCG	2	6	6921	6926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654610
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258	NC_009007	CGAC	2	8	10263	10270	25 %	0 %	25 %	50 %	125654614
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260	NC_009007	CGG	2	6	10381	10386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654614
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263	NC_009007	TGC	2	6	10452	10457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654614
264	NC_009007	CG	3	6	10470	10475	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
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266	NC_009007	GGGC	2	8	10504	10511	0 %	0 %	75 %	25 %	125654614
267	NC_009007	CGC	2	6	10531	10536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654614
268	NC_009007	GCCT	2	8	10538	10545	0 %	25 %	25 %	50 %	125654614
269	NC_009007	GC	3	6	10553	10558	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
270	NC_009007	CGGCC	2	10	10566	10575	0 %	0 %	40 %	60 %	125654614
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272	NC_009007	GGC	2	6	10604	10609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654614
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274	NC_009007	GGC	2	6	10779	10784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654614
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382	NC_009007	GCCGC	2	10	15255	15264	0 %	0 %	40 %	60 %	125654619
383	NC_009007	GGA	2	6	15274	15279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654619
384	NC_009007	AGGGTC	2	12	15315	15326	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	125654619
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388	NC_009007	G	7	7	15485	15491	0 %	0 %	100 %	0 %	125654620
389	NC_009007	ACC	2	6	15505	15510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654620
390	NC_009007	CGC	2	6	15513	15518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654620
391	NC_009007	GCC	3	9	15531	15539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654620
392	NC_009007	CCCG	2	8	15640	15647	0 %	0 %	25 %	75 %	125654620
393	NC_009007	CG	3	6	15662	15667	0 %	0 %	50 %	50 %	125654620
394	NC_009007	CGC	2	6	15695	15700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654620
395	NC_009007	CGG	2	6	15728	15733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654620
396	NC_009007	TCA	2	6	15737	15742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654620
397	NC_009007	GCCC	2	8	15752	15759	0 %	0 %	25 %	75 %	125654620
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